106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1833 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 265 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 315 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 282 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 282 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  51.5 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  51.72 
 
 		 271 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  52.57 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  52.16 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 267 aa  241  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  49.22 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  53.94 
 
 		 271 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  53.11 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 272 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 272 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  48.85 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  53.53 
 
 		 271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  51.31 
 
 		 275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  52.45 
 
 		 273 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 267 aa  224  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  47.29 
 
 		 269 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  48.18 
 
 		 273 aa  205  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  46.12 
 
 		 288 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  44.14 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  42.53 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  44.66 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  44.54 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  39.15 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  38.66 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 241 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  37.92 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  35.66 
 
 		 285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 120 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 99 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 119 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 150 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  38.98 
 
 		 158 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  33.96 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 487 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 114 aa  46.2  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  42 
 
 		 91 aa  45.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 116 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  45.83 
 
 		 48 aa  45.4  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  38.98 
 
 		 138 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  37.5 
 
 		 109 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 112 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.07 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  38.6 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 104 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 104 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 104 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>