83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3292 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  79.1 
 
 		 270 aa  371  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 272 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 272 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  68.72 
 
 		 273 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  55.91 
 
 		 274 aa  262  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  51.41 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  57.87 
 
 		 275 aa  241  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  49.8 
 
 		 262 aa  238  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  47.79 
 
 		 271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 285 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 306 aa  228  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  51.45 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  51.68 
 
 		 271 aa  222  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  48.61 
 
 		 288 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 315 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 282 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 282 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 282 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  46.98 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  48.73 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  46.72 
 
 		 284 aa  201  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  44.53 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 281 aa  191  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  43.44 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 287 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  41.13 
 
 		 270 aa  174  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 277 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  40.08 
 
 		 296 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  44.13 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  37.75 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  37.3 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  42.29 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 915 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  52.63 
 
 		 48 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 779 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0622  hypothetical protein  30.77 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 326 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0773  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  42 
 
 		 91 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 84 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 72 aa  42.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>