77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2438 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  71.26 
 
 		 284 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  62.17 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  59.21 
 
 		 288 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  60.31 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  65.91 
 
 		 267 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  62.4 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  61.57 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  60.3 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  63.08 
 
 		 271 aa  298  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 271 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 271 aa  291  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  58.69 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 268 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  56.23 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  55.09 
 
 		 275 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  57.83 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  58.24 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  51.36 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 272 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 272 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  49.22 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 267 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  52.05 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  49.24 
 
 		 288 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  49.61 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  50.39 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 287 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 278 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  45.85 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  41.92 
 
 		 270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  42.21 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 277 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  46.12 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  39.93 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 271 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  38.23 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 271 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 272 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 272 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  32.83 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  40.68 
 
 		 75 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 71 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 761 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 84 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 48 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  36.07 
 
 		 158 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1015 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>