85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6073 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  52.96 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  54.14 
 
 		 274 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  51.1 
 
 		 288 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  51.65 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 		 284 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 282 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 282 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 282 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 267 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  48.75 
 
 		 271 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  50.79 
 
 		 273 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  47.67 
 
 		 275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 264 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 271 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  48.26 
 
 		 271 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  44.4 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  47.01 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 272 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 272 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  42.91 
 
 		 288 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  39.31 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  41.7 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  42.96 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  47.13 
 
 		 265 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  40.29 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  39.77 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  42.26 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  36.06 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  36.13 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 254 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 272 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 280 aa  99.4  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.45 
 
 		 915 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 477 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 195 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  46 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  30.71 
 
 		 230 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 477 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 761 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 477 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  28.17 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 		 197 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 149 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  38.89 
 
 		 149 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 92 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>