74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3397 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  93.95 
 
 		 282 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  93.57 
 
 		 282 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  93.95 
 
 		 282 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  93.57 
 
 		 282 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  93.21 
 
 		 282 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  93.24 
 
 		 282 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  70.25 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  70.8 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  71.64 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  61.69 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 268 aa  308  6.999999999999999e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  61.51 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  59.7 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  62.4 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 267 aa  291  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  59 
 
 		 271 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  58.2 
 
 		 267 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  56.4 
 
 		 271 aa  285  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  56.81 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  57.94 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  57.09 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  57.54 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  59 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  57.72 
 
 		 275 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  58.13 
 
 		 273 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 267 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  54.26 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  51.75 
 
 		 262 aa  262  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 313 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  54.77 
 
 		 273 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  50.73 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  46.74 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  51.79 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  48.59 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  47.43 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  42.91 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  41.92 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  44.94 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  47.72 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  39.79 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 302 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  37.55 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  37.11 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  38.65 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  36.94 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 263 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  51.16 
 
 		 48 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 915 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 70 aa  42.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>