135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6350 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 283 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  85.66 
 
 		 276 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  62.23 
 
 		 281 aa  345  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  59.49 
 
 		 285 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 302 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  42.52 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  42.57 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  38.52 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  38.35 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  37.41 
 
 		 318 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 282 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  38.17 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  39.08 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  37.89 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  35.74 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  36.43 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  43.12 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  31.58 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  26.94 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  32.98 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  32.98 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  32.98 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1603  hypothetical protein  32.98 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1226  putative DNA-binding protein  32.46 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1067  hypothetical protein  32.46 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1073  hypothetical protein  32.46 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0773  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0622  hypothetical protein  30.39 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  29.34 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2773  hypothetical protein  21.97 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0588  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.38 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0530  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0566101  hitchhiker  0.0000527807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2432  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.732467  normal  0.678442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  26.38 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  28.09 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0902  hypothetical protein  26.54 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>