71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0311 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  32.25 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  31.29 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  31.84 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  31.7 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  32.42 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  31.42 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  30.29 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  33.58 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  34.26 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  30.8 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  29.59 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  30.42 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  32.16 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  30.83 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  47.75 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  31.6 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  30.15 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  27.95 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  46.34 
 
 		 91 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>