122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0349 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
277 aa  534  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  46.84 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  45.79 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  45.79 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  45.42 
 
 
282 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  45.42 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  45.09 
 
 
282 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 
306 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  45.15 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  45.66 
 
 
274 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  46.56 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  44.94 
 
 
271 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  42.44 
 
 
296 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  45.25 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  45.25 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  45.49 
 
 
271 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  42.64 
 
 
294 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  45.63 
 
 
264 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 
318 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  43.91 
 
 
288 aa  175  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  43.26 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  45.66 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  43.87 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  42.75 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  45.34 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  40.53 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  42.75 
 
 
271 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 
302 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  45.93 
 
 
275 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  42.18 
 
 
297 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
283 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  43.13 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
281 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  38.11 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
276 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  40.74 
 
 
270 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 
267 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  44.27 
 
 
273 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  39.7 
 
 
288 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  42.06 
 
 
244 aa  158  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  44.22 
 
 
284 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 
264 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  41.63 
 
 
273 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  42.23 
 
 
269 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  42.04 
 
 
267 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 
264 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
261 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  42.23 
 
 
270 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  40.36 
 
 
288 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  43.43 
 
 
265 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 
313 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 
281 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 
254 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  39.84 
 
 
278 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  41.83 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  36.82 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 
305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  35.79 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
272 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 
271 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  29.5 
 
 
280 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  47.95 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  30.86 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 
259 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  34.76 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  53.45 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  31.07 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  31.16 
 
 
278 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 
92 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 
92 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  28.06 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0023  XRE family transcriptional regulator  28.52 
 
 
301 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  31.03 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  31.32 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  32.04 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 
145 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2773  hypothetical protein  32.48 
 
 
283 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 
304 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
195 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  29.05 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  31.55 
 
 
292 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.11 
 
 
144 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0208  XRE family transcriptional regulator  39.36 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  31.05 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  39.06 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
195 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  28.87 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  33.55 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  35.35 
 
 
468 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  29.59 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>