41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2269 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 48 aa  97.1  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  63.41 
 
 		 273 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  54.55 
 
 		 271 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  51.16 
 
 		 270 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 261 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  57.5 
 
 		 318 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  57.5 
 
 		 297 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 288 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  56.76 
 
 		 296 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 282 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  55.88 
 
 		 278 aa  47.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 282 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 282 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 282 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 282 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 282 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 282 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 315 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 264 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 281 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 288 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 310 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 244 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  52.5 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 284 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 294 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 313 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 287 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 265 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 263 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  44.19 
 
 		 274 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  54.29 
 
 		 275 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>