56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1891 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1891  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00988673  normal  0.0163804 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2503  transcriptional regulator, XRE family  77.78 
 
 		 117 aa  191  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2363  transcriptional regulator, XRE family  74.36 
 
 		 117 aa  186  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2134  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.86 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0677285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.01 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.96581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1114  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  59.21 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2140  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3124  XRE family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3435  XRE family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0322036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2570  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  41.79 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0384  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1305  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  42.86 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  40 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 513 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  31.43 
 
 		 516 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0604  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 252 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 265 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2561  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.333504  normal  0.0163697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0167  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  42 
 
 		 488 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0131  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.169212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 335 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1226  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0692  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 241 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0543  helix-turn-helix domain protein  43.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5730  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 239 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 152 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 83 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 410 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1647  DNA-binding protein  41.51 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.68181  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  34.25 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  30.91 
 
 		 476 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 503 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  57.14 
 
 		 220 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  52.5 
 
 		 259 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 68 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 68 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 277 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>