More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0777 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  167  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  67.61 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 81 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  42.62 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4072  helix-turn-helix domain protein  53.57 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  44.9 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  43.4 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  43.4 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  43.4 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.35 
 
 		 377 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  43.4 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  43.4 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3707  molybdate metabolism transcriptional regulator  47.54 
 
 		 374 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.38 
 
 		 376 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  38.1 
 
 		 377 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  40.68 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  45.28 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  35.37 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  46.67 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  38.98 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.38 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 73 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 383 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  37.29 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  44.44 
 
 		 352 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  41.51 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4108  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  41.51 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  41.51 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>