More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0118 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 81 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  67.61 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0917  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  41.27 
 
 		 377 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  44.64 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  36.67 
 
 		 377 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4072  helix-turn-helix domain protein  45 
 
 		 380 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  34.92 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  42.86 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  35 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  38.33 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  40.98 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  41.38 
 
 		 383 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2643  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  32.84 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.38 
 
 		 376 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2581  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  38.71 
 
 		 652 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>