44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2503 on replicon NC_013224
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013224  Dret_2503  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2363  transcriptional regulator, XRE family  92.31 
 
 		 117 aa  223  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1891  transcriptional regulator, XRE family  77.78 
 
 		 117 aa  191  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00988673  normal  0.0163804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.86 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.96581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2140  transcriptional regulator, XRE family  44.54 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2134  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.88 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0677285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1114  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  56.52 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3124  XRE family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3435  XRE family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0322036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2570  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  42.25 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0384  hypothetical protein  51.72 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  65.71 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 241 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  43.14 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  41.07 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1305  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 97 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 252 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 288 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 283 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  54.29 
 
 		 259 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  30.99 
 
 		 516 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1226  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  42 
 
 		 488 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0692  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0131  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.169212  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2561  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.333504  normal  0.0163697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 288 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0356  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 194 aa  40  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3664  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000706861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 265 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1647  DNA-binding protein  28.32 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.68181  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 816 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>