139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2077 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  99.59 
 
 
490 aa  983    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
490 aa  986    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  65.09 
 
 
524 aa  598  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  61.93 
 
 
490 aa  598  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  62.55 
 
 
474 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  60.54 
 
 
474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  60.08 
 
 
470 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 
471 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  60.5 
 
 
461 aa  518  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  54.68 
 
 
475 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  51.65 
 
 
475 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  49.9 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  50.1 
 
 
466 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  51.67 
 
 
474 aa  465  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  48.97 
 
 
475 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  48.97 
 
 
475 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  48.97 
 
 
475 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  54.13 
 
 
471 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  49.27 
 
 
475 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  50 
 
 
474 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  49.9 
 
 
486 aa  455  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  45.64 
 
 
472 aa  398  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  44.61 
 
 
472 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  49.13 
 
 
461 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  44.61 
 
 
470 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  45.23 
 
 
470 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  51.46 
 
 
455 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  44.54 
 
 
477 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  44.75 
 
 
477 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
477 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 
491 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  44.61 
 
 
481 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  43.89 
 
 
464 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  43.89 
 
 
469 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
477 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  42.71 
 
 
476 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
474 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 
483 aa  358  9e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  41.44 
 
 
483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 
480 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  42.15 
 
 
461 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  42.15 
 
 
461 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  42.45 
 
 
464 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  42.51 
 
 
461 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  40.41 
 
 
483 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  40.21 
 
 
482 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  40 
 
 
480 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  40.41 
 
 
481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  39.59 
 
 
480 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
477 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  41.8 
 
 
474 aa  332  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
466 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  43.9 
 
 
469 aa  330  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 
473 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  40.85 
 
 
484 aa  322  7e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  43.01 
 
 
477 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 
495 aa  316  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  39.75 
 
 
506 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  36.23 
 
 
468 aa  306  6e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 
476 aa  299  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 
479 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.87 
 
 
475 aa  293  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  36.82 
 
 
467 aa  286  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  37.76 
 
 
464 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  40.17 
 
 
472 aa  266  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  35.95 
 
 
474 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  35.06 
 
 
483 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  34.65 
 
 
470 aa  257  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  34.65 
 
 
470 aa  257  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  37.06 
 
 
469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  38.35 
 
 
463 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  36.44 
 
 
470 aa  253  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 
491 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  36.63 
 
 
469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  36.83 
 
 
469 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 
462 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  52.8 
 
 
149 aa  134  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  27.33 
 
 
431 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  28.93 
 
 
443 aa  97.4  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  28.11 
 
 
428 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  28.23 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  27.8 
 
 
428 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  21.82 
 
 
493 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  25.75 
 
 
440 aa  60.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  24.07 
 
 
504 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  23.75 
 
 
505 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  24.77 
 
 
504 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  21.1 
 
 
500 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  33.87 
 
 
428 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  23.76 
 
 
490 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 
199 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 
432 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 
175 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
199 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 
199 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
199 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
199 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 
252 aa  50.4  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>