173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3929 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  95.32 
 
 		 470 aa  915    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  95.32 
 
 		 470 aa  915    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  978    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  66.38 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  66.88 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  65.18 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  64.76 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  64.33 
 
 		 469 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  41.47 
 
 		 480 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 481 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  40.21 
 
 		 480 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  43.01 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 483 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 488 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 464 aa  285  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  37.39 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  37.77 
 
 		 476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 476 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 477 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  36.56 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  36.13 
 
 		 477 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 474 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  35.56 
 
 		 467 aa  269  8e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 474 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  36.85 
 
 		 468 aa  266  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  38.95 
 
 		 469 aa  264  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 490 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  34.68 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  37.19 
 
 		 479 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  34.99 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  33.97 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  34.39 
 
 		 470 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  34.61 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  34.61 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  34.61 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  33.91 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 464 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  34.52 
 
 		 482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  33.62 
 
 		 477 aa  243  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 477 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 490 aa  242  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  35.78 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  34.84 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 472 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 463 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  34.92 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 474 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  34.89 
 
 		 524 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  37.12 
 
 		 461 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 491 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 461 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  34.27 
 
 		 461 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  33.55 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 466 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  37.63 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  35.28 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  31.57 
 
 		 475 aa  219  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 495 aa  208  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  33.92 
 
 		 461 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 471 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  31.65 
 
 		 474 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  35.49 
 
 		 455 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  27.68 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 149 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  25.05 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  24.09 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  24.51 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 490 aa  57  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  49.33 
 
 		 191 aa  57  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 197 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  24.29 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 197 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  42.31 
 
 		 201 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  25.98 
 
 		 504 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  25.63 
 
 		 486 aa  53.5  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 199 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  44.83 
 
 		 191 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>