More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4441 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 123 aa  240  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  31.53 
 
 		 371 aa  58.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  43.48 
 
 		 209 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  42.62 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 209 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 181 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 201 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 203 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  33.66 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 186 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 185 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 185 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 185 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 185 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  35.8 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  34 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  35.8 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  34 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  34 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 185 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 197 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  37.31 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  33 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  41.27 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  41.27 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  41.27 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 207 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.08 
 
 		 481 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  31 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 212 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 208 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2665  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 233 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000943632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 198 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 248 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  35.23 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 211 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 203 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  36.76 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 203 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 403 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  39.06 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  40.32 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 222 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  33.8 
 
 		 202 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 201 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>