27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0820 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 79 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 80 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  64.1 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  48.61 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5431  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716387  normal  0.867638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43580  DNA binding protein, XRE-like protein  46.67 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.485824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  35.14 
 
 		 235 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 279 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3385  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4031  XRE family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.858841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0775  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 622 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000679131  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5036  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5848  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0072  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1931  XRE family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  34.92 
 
 		 98 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>