218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5594 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 92 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 92 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3268  XRE family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  45 
 
 		 308 aa  54.3  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  41.67 
 
 		 302 aa  52  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 93 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4795  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 277 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  36.51 
 
 		 303 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1959  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.127837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 505 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  32.84 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 474 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0155  helix-turn-helix domain-containing protein  37.18 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 193 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40.32 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 195 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 528 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0958  DNA-binding protein  31.67 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 200 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  38.1 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  38.1 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  38.1 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 199 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1421  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.88 
 
 		 327 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 177 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  43.5  0.0009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  31.25 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  40 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6209  hypothetical protein  42.62 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  29.21 
 
 		 323 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  39.29 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  43.86 
 
 		 475 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2697  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  29.27 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6641  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.1 
 
 		 342 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>