26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0958 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0958  DNA-binding protein  100 
 
 		 80 aa  160  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  32.81 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 198 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  37.29 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  30.16 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0501  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  34.85 
 
 		 312 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 213 aa  41.2  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 505 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1064  helix-turn-helix domain-containing protein  28.81 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0106  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>