98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3268 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3268  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
104 aa  209  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  73.17 
 
 
83 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  53.66 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  53.66 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 
187 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
93 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 
207 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.86 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  45.16 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.55 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  37.66 
 
 
308 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  40.32 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  41.94 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  39.71 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
224 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0230  DNA-binding protein  37.5 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0592162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 
195 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  38.71 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 
216 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
187 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  44.26 
 
 
248 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
259 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 
260 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  38.71 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6209  hypothetical protein  38.57 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 
141 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  34.62 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 
85 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 
139 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  38.6 
 
 
303 aa  41.6  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
84 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
100 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  36.51 
 
 
75 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 
112 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
190 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
230 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 
210 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  36.67 
 
 
302 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  40.24 
 
 
488 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 
252 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 
203 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  43.75 
 
 
210 aa  40.4  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
57 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 
68 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  35.9 
 
 
137 aa  40  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>