118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6372 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6372  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 123 aa  245  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2781  putative transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161567  normal  0.999389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  33.8 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0014  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.881591  normal  0.120221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0016  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711578 
 
 
-
 
NC_004310  BR2159  Cro/CI family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00000314405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 252 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2071  Cro/CI family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0247654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0045  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000742068  hitchhiker  0.0000000000614145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0753  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.057083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 366 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0443  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000554716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 236 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0021  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 236 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 474 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 432 aa  43.5  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 146 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 189 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  33.65 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 433 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3598  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00212083  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 206 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 110 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.25 
 
 		 376 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  43.4 
 
 		 365 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 378 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1232  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236768  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 191 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 191 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  33.87 
 
 		 347 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 191 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 266 aa  40.8  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 491 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3923  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.680179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1427  CI repressor  43.86 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  30.97 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 181 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 181 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>