124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1144 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 266 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  51.06 
 
 		 90 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 169 aa  52.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 100 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0502  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  48.98 
 
 		 91 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 134 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 183 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 183 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 183 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 98 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 183 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 183 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 183 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  39.51 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 183 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 		 93 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  48.08 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.08 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 99 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.1 
 
 		 376 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 108 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 88 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 103 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 77 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 99 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  43.64 
 
 		 189 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  43.64 
 
 		 189 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  43.64 
 
 		 183 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  43.64 
 
 		 183 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  42.31 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1931  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 88 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 174 aa  45.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 81 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  46 
 
 		 64 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  35.11 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 72 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 72 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 181 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 68 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  37.04 
 
 		 94 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  41.82 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 63 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 140 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 105 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 83 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  40.38 
 
 		 62 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 117 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2366  transcriptional regulator, XRE family  31.78 
 
 		 184 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  44.68 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 176 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  40.43 
 
 		 101 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 83 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 100 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 72 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 60 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  42.86 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.51 
 
 		 377 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2226  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 136 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.782341  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 190 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 432 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 69 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  44.68 
 
 		 75 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  43.28 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 83 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  39.68 
 
 		 377 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 86 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  44.9 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>