More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1292 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 110 aa  210  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  40.59 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  36.45 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  42.25 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  39.73 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.51 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  40.32 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  32 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  32 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 504 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  32 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  34.58 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  34.58 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  41.54 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 478 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 432 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 281 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 277 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 380 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  31.86 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 490 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 490 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  40 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  37.08 
 
 		 349 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 433 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 495 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  40 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.94 
 
 		 481 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  31.53 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 244 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 199 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  23.36 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  42.62 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  35.21 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  32.11 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  32.11 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  32.86 
 
 		 489 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 374 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 273 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  32.11 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 488 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  33.03 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  38.33 
 
 		 488 aa  48.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 268 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 300 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  34.48 
 
 		 338 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  33.85 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>