56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1044 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 104 aa  218  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  218  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  54.9 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1389  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0928  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00442924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  37.7 
 
 		 229 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  37.7 
 
 		 229 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  36 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  34.18 
 
 		 234 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 321 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1861  prophage LambdaSa2, Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000549862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 252 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 359 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.92 
 
 		 406 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  32.98 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  28.77 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  30.16 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  51.43 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  35 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  29.21 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  30.21 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  30.21 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  29.21 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  29.21 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  27.45 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  34.43 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  35 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  32.79 
 
 		 229 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 490 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  36.07 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  39.68 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 229 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2624  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 205 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>