162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A15 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  38.94 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  44.3 
 
 		 149 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  39.82 
 
 		 149 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  39.82 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  38.05 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  41.77 
 
 		 92 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  36.89 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  37.88 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  34.34 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  33.82 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.03 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  33.71 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  30.95 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  39.34 
 
 		 459 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 395 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  31.31 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 276 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  39.73 
 
 		 293 aa  51.6  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.33 
 
 		 114 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  43.33 
 
 		 114 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 115 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 115 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 364 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 118 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 99 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  45.28 
 
 		 369 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 110 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 277 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 322 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 108 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 135 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 65 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 151 aa  48.5  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  35 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 114 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 104 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 372 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 113 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 123 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 359 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 109 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 69 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  34.92 
 
 		 68 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 70 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 73 aa  45.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 433 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  34.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  39.24 
 
 		 139 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>