More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2015 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  41.25 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  44.19 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  40.96 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 321 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  39.13 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  39.13 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  39.08 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 231 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  42.03 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  39.08 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  38.2 
 
 		 322 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  48.48 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  38.46 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  46.03 
 
 		 301 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 273 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  34.15 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  42.19 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  33.8 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.76 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  46.03 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  44.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.84 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 327 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  40 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  40 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  40 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  40.32 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  41.38 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.53 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.53 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.08 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.08 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 		 338 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1818  helix-turn-helix domain protein  45.9 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0350108  decreased coverage  0.0000000000623016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.38 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  35.38 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 380 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>