135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2429 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 127 aa  255  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  59.84 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.24 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  36.99 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.47 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.47 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.47 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.51 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.51 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  37.33 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  28.32 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 334 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 231 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 262 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 262 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  38.1 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  41.27 
 
 		 301 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  37.88 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  26.72 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  38.33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  38.33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  25.2 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1223  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.69 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.995499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 328 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0904  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  33.85 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  29.52 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  26.09 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  24.19 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  36 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  33.75 
 
 		 293 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2192  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 359 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2393  helix-turn-helix domain protein  35.21 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 322 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 380 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0094  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0157  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  33.9 
 
 		 459 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  40.98 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2184  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 289 aa  42.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>