More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0099 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  56.16 
 
 
293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  33.33 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  33.64 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  35.18 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  33.48 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  34.43 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
300 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 
300 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
300 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  34.36 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  30.05 
 
 
310 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  35.1 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 
300 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  32.59 
 
 
309 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl646  putative multidrug ABC transporter ATP-binding component  29.38 
 
 
234 aa  107  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  31 
 
 
302 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  34.27 
 
 
300 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  28.63 
 
 
326 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  31.71 
 
 
322 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
316 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  34.48 
 
 
303 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.41 
 
 
339 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1708  ABC transporter related  35.05 
 
 
323 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249646  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.06 
 
 
311 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3848  ABC transporter related protein  30.88 
 
 
325 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  31.82 
 
 
329 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5934  heme exporter protein CcmA  29.7 
 
 
243 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  34.18 
 
 
322 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 
299 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  33.5 
 
 
297 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3748  ABC transporter related  34.18 
 
 
322 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26967  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  32.31 
 
 
355 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  30.66 
 
 
347 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  31.88 
 
 
322 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  29.91 
 
 
232 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.7 
 
 
239 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.49 
 
 
668 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  33.67 
 
 
653 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  34.01 
 
 
325 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  28.15 
 
 
299 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  28.15 
 
 
299 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  34.43 
 
 
629 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0617  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.58 
 
 
329 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899529  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  31.42 
 
 
306 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  32.55 
 
 
304 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  31.91 
 
 
626 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.49 
 
 
709 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 
622 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  29.09 
 
 
304 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  32.84 
 
 
307 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  28.63 
 
 
262 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0504  ABC transporter related  30.69 
 
 
239 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  30.62 
 
 
325 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  30.7 
 
 
312 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  29.91 
 
 
342 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  32 
 
 
319 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  32.46 
 
 
380 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  33.68 
 
 
594 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  30.32 
 
 
308 aa  99.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  30.99 
 
 
343 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  31 
 
 
642 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  31.31 
 
 
253 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4875  ABC transporter related  31.36 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.94 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  34.34 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  31.73 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  31.98 
 
 
639 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  31.98 
 
 
241 aa  98.6  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  34.25 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.52 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  32.39 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  31.31 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  32.38 
 
 
241 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  32.09 
 
 
498 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  31.55 
 
 
242 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  32.7 
 
 
691 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3447  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0135545  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  31.5 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  29.8 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  27.54 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  32.05 
 
 
536 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  30.77 
 
 
629 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  33.18 
 
 
631 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  31.5 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.51 
 
 
690 aa  97.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1419  ABC transporter related protein  31.51 
 
 
279 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  30.87 
 
 
630 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.88 
 
 
380 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  29.15 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  30.21 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>