118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1982 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
359 aa  732    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  55.18 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  25.84 
 
 
374 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  25.9 
 
 
374 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  25.34 
 
 
374 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  25.07 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  24.79 
 
 
374 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  24.79 
 
 
374 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  24.52 
 
 
374 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  25.55 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  27.7 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  24.52 
 
 
374 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  26.37 
 
 
369 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  22.49 
 
 
380 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  24.75 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  24.09 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  50 
 
 
459 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
185 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  39.71 
 
 
194 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  42.59 
 
 
114 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  42.59 
 
 
114 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
208 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  43.33 
 
 
186 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 
115 aa  56.6  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 
115 aa  56.6  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
189 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 
189 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 
205 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  36.67 
 
 
196 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 
134 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  40.38 
 
 
146 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  46.15 
 
 
189 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
118 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  44.23 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  40.38 
 
 
142 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 
192 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
163 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
268 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
176 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 
197 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  37.7 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 
123 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  36.21 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  37.29 
 
 
143 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  35.56 
 
 
144 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  40.74 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  35.59 
 
 
262 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  35.59 
 
 
262 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  38.3 
 
 
200 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 
262 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
262 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  41.3 
 
 
145 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3316  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 
126 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0996495  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  38.46 
 
 
235 aa  49.7  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
364 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
115 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  32.05 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
273 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
277 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  40 
 
 
197 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  33.33 
 
 
92 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  30.43 
 
 
259 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  27.66 
 
 
107 aa  47.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  31.15 
 
 
210 aa  47.4  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  35.09 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  35 
 
 
149 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 
196 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 
137 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 
395 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
197 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  33.33 
 
 
149 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
281 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
139 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 
185 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  36.84 
 
 
206 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 
147 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 
204 aa  46.2  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
183 aa  46.2  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
85 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
135 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  34.48 
 
 
108 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
327 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  37.7 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  35.85 
 
 
108 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
104 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  32.2 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
194 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 
142 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
132 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>