229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1445 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 147 aa  307  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  59.86 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  55.41 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  51.35 
 
 		 272 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1222  hypothetical protein  46.91 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.505926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1844  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3784  hypothetical protein  40.96 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0685448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1446  hypothetical protein  42.5 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 205 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  44.64 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  43.55 
 
 		 369 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1002  hypothetical protein  46.3 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0344613  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 185 aa  52.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  35.29 
 
 		 240 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 268 aa  52  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 334 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 197 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  40.38 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 273 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1438  hypothetical protein  34.12 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  38.33 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  38.33 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  51.35 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 244 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  48.65 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  43.4 
 
 		 328 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  34.33 
 
 		 436 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  48.72 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 374 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 327 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 368 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  48.65 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  36.67 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  48.65 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 374 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  38.6 
 
 		 459 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 242 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 374 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  36.84 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  34.48 
 
 		 374 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 374 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 203 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 374 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 395 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  32.43 
 
 		 327 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  31.75 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 364 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0971  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.508784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1168  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.092853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5451  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  46 
 
 		 362 aa  45.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0430  hypothetical protein  43.08 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000305974  unclonable  0.0000000000163363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  32.79 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1041  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 320 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>