194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0733 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  340  5e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  55.41 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  47.33 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  40.67 
 
 		 272 aa  124  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1222  hypothetical protein  43.21 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.505926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1844  hypothetical protein  39.08 
 
 		 90 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1446  hypothetical protein  37.04 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  38.24 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3784  hypothetical protein  37.04 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0685448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  44.78 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 252 aa  57.4  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  36.67 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  39.39 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  35.82 
 
 		 436 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  35 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 85 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2076  hypothetical protein  30.49 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  26.81 
 
 		 348 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  34.92 
 
 		 262 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 262 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 200 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 262 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  34.92 
 
 		 262 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  28.05 
 
 		 374 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1002  hypothetical protein  43.4 
 
 		 89 aa  47.4  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0344613  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 296 aa  47.4  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1438  hypothetical protein  31.91 
 
 		 87 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 374 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  28.26 
 
 		 374 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 513 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 374 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  30.65 
 
 		 374 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 239 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.3 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 374 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  29.03 
 
 		 374 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  29.03 
 
 		 374 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  33.75 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  30.36 
 
 		 459 aa  45.1  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 364 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 361 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 368 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  43.75 
 
 		 516 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 198 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  36.51 
 
 		 285 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  24.46 
 
 		 250 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 273 aa  44.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 118 aa  44.3  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  36.51 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  36.51 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  36.51 
 
 		 285 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 132 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 199 aa  43.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  30 
 
 		 358 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  30.16 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  36.51 
 
 		 285 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  36.51 
 
 		 285 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  29.51 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  32.93 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 513 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>