123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06250 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 74 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 74 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  50.91 
 
 		 436 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 183 aa  52  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  44.07 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  25.49 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  44.26 
 
 		 72 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 117 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 72 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 71 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 71 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 361 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  32.5 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  32.5 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  42.31 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 183 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 		 141 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 152 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  35 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 185 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 185 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 185 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 149 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 185 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  42.55 
 
 		 293 aa  45.4  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 163 aa  45.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  47.73 
 
 		 369 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5909  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  40.3 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  40.3 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5287  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.511676  normal  0.279945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  29.91 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 111 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 374 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 374 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  32.86 
 
 		 374 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 374 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  36.92 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  32.81 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 103 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 103 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 103 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 113 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  31.88 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 173 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 125 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 364 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  40.35 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 137 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>