152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4003 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  32.56 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  35.23 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  35.23 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  35.8 
 
 		 95 aa  50.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 268 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  37.7 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  50 
 
 		 293 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  46.81 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  31.46 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  32.93 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  32.93 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  46.51 
 
 		 459 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  45.24 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  51.16 
 
 		 380 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 374 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  31.43 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  31.03 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  30.68 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1298  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0435661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  25.56 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  36.96 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  29.87 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  39.13 
 
 		 436 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4487  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4620  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157225  normal  0.499919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 133 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 182 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  25.27 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 528 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  45.24 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  45.24 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  45.24 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  45 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>