173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B1350 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  100 
 
 
62 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3830  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  42.86 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0176274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4125  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  42.86 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.893479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4027  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  42.86 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.571082  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  45.61 
 
 
227 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  51.92 
 
 
72 aa  52  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  54 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  36.84 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5468  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.624713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  38.71 
 
 
73 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  38.46 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  38.46 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  38.46 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  38.46 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  38.46 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  38.46 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  38.46 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  38.46 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  45.65 
 
 
272 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
334 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  38.46 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
296 aa  47.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  39.29 
 
 
369 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
268 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
118 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
327 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.83 
 
 
377 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  38.71 
 
 
181 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 
208 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  38.71 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 
206 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 
380 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1184  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 
374 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.78 
 
 
262 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 
262 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 
198 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  33.33 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  30.77 
 
 
186 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  33.33 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  33.33 
 
 
293 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 
262 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  38.78 
 
 
262 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  41.03 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
205 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 
322 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  31.58 
 
 
328 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  44.26 
 
 
377 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
64 aa  44.3  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 
196 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  40.38 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  33.33 
 
 
235 aa  43.9  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  38.89 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  35.85 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.83 
 
 
376 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5184  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
1330 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219176  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  32.26 
 
 
358 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
395 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  40 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>