26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3830 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A4027  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  100 
 
 		 75 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.571082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3830  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  100 
 
 		 75 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0176274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4125  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  100 
 
 		 75 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.893479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  32.79 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  33.93 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  36.59 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 72 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  37.74 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 320 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0343  putative HTH-type transcriptional regulator  31.51 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254339  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  36.07 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  30 
 
 		 293 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 99 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>