127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0914 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  61.05 
 
 		 104 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1719  transcriptional regulator, XRE family  61.05 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  68.12 
 
 		 79 aa  102  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0490  Fis family transcriptional regulator  28 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 513 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 199 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  40.68 
 
 		 347 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  29.49 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 276 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 513 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  33.85 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  35.71 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  35.71 
 
 		 516 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  34.43 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.34 
 
 		 517 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  32.14 
 
 		 508 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 490 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3830  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  40 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0176274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4125  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  40 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.893479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  30.99 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4027  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  40 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.571082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  31.25 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  34.62 
 
 		 84 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.66 
 
 		 81 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 106 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 503 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 105 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  32.39 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  38.6 
 
 		 376 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.08 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.08 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4562  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  32.08 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0908  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  32.08 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  37.29 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.08 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 361 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.29 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  35.29 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  28.07 
 
 		 469 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 239 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>