137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0935 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  39.23 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  41.43 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 		 355 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 296 aa  49.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 380 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  36.36 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  32.05 
 
 		 200 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 395 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  34.48 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 380 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 358 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  33.93 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1142  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343255  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  33.93 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  34.48 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  34.48 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  33.93 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  34.48 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  35.59 
 
 		 227 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  32.2 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  32.76 
 
 		 293 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 268 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 513 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  28.77 
 
 		 303 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 252 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 312 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 192 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  32.76 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  30.77 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3038  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  29.41 
 
 		 459 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 261 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  29.85 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  29.85 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  29.51 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15940  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0473945  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5686  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  0.066363 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 99 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 198 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  24.44 
 
 		 200 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 68 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  27.94 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  28.17 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  24.72 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0386  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617682 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  31.82 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 320 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  27.14 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>