40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5468 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5468  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.624713 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5451  XRE family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5881  XRE family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5481  XRE family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4878  transcriptional regulator, XRE family  33.81 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2219  helix-turn-helix domain-containing protein  31.94 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  38.24 
 
 		 400 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  36.11 
 
 		 401 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 62 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 252 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 88 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1922  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 82 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 359 aa  42.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  32.35 
 
 		 293 aa  42.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 268 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  41.3 
 
 		 74 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1142  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 141 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343255  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 390 aa  41.6  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  30.16 
 
 		 262 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 262 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  32.81 
 
 		 114 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.81 
 
 		 114 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 105 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  30.16 
 
 		 262 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  30.16 
 
 		 262 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  30.19 
 
 		 194 aa  40.8  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2142  helix-turn-helix domain protein  32.76 
 
 		 96 aa  40.8  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 81 aa  40.8  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  32.22 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>