202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1817 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 945 aa  1928    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  37.37 
 
 		 830 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  31.56 
 
 		 977 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  31.03 
 
 		 284 aa  131  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1381 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  34.11 
 
 		 398 aa  128  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  30.83 
 
 		 395 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.41 
 
 		 825 aa  101  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.6 
 
 		 1411 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1450 aa  87.8  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 1060 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  35.53 
 
 		 828 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 1195 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  26.95 
 
 		 1602 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 1596 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.06 
 
 		 991 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  30.43 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 		 1266 aa  77.8  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  31.5 
 
 		 732 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  32.56 
 
 		 941 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.41 
 
 		 782 aa  72.8  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 843 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  31.21 
 
 		 957 aa  71.2  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.77 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 		 742 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1261 aa  69.3  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 809 aa  68.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1123 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.93 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 1526 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  29.73 
 
 		 1009 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02023  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 		 304 aa  67  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1444  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 181 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1720  hypothetical protein  36.73 
 
 		 120 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  27.49 
 
 		 1914 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 965 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 343 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  23.55 
 
 		 848 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  24.08 
 
 		 946 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  33.15 
 
 		 702 aa  65.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 1285 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  25.4 
 
 		 1478 aa  65.1  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.72 
 
 		 1424 aa  65.1  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02326  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14650)  28.99 
 
 		 664 aa  64.3  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  31.17 
 
 		 493 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 872 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  30.67 
 
 		 1119 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  28.84 
 
 		 992 aa  62.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.75 
 
 		 809 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1714 aa  61.6  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  25.44 
 
 		 816 aa  61.6  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3987  hypothetical protein  26.4 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  23.88 
 
 		 407 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  27.1 
 
 		 340 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1054 aa  60.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 438 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  29.09 
 
 		 970 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.41 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 850 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 1298 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  22.82 
 
 		 888 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1238 aa  57.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.49 
 
 		 1288 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.48 
 
 		 1131 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 714 aa  57.4  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  30.36 
 
 		 1611 aa  57.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  30.46 
 
 		 2145 aa  57.4  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  28.68 
 
 		 818 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 1290 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1105 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 1025 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.52 
 
 		 1295 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  26.09 
 
 		 600 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  24.11 
 
 		 1104 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25.11 
 
 		 985 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 923 aa  55.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.8 
 
 		 560 aa  55.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  27.06 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  23.81 
 
 		 673 aa  55.1  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 833 aa  54.7  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  22.88 
 
 		 689 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  27.67 
 
 		 1204 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1916  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1172 aa  53.9  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.506674  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 		 814 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  29.33 
 
 		 421 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 421 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  25.71 
 
 		 696 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.44 
 
 		 1186 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 817 aa  52.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  24.85 
 
 		 934 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  27.91 
 
 		 788 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1719  hypothetical protein  26.19 
 
 		 217 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.680386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  29.17 
 
 		 708 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 1162 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 901 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 911 aa  52.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  27.48 
 
 		 599 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  26.14 
 
 		 1025 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 729 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  27.43 
 
 		 724 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>