21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2101 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  100 
 
 
673 aa  1384    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1848  hypothetical protein  32.64 
 
 
517 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0922205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  27.07 
 
 
284 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
945 aa  62  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  29.93 
 
 
1478 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  22.96 
 
 
1381 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  28.72 
 
 
1602 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  23.38 
 
 
239 aa  54.7  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  25.21 
 
 
395 aa  53.9  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  21.28 
 
 
233 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02023  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 
304 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  21.63 
 
 
398 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  26.14 
 
 
407 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  23.93 
 
 
977 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03551  hypothetical protein  28.26 
 
 
1124 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  21.19 
 
 
234 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  20.69 
 
 
235 aa  47.4  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  26.9 
 
 
231 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  24.04 
 
 
189 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2210  hypothetical protein  36.07 
 
 
233 aa  43.9  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  22.97 
 
 
958 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>