22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3057 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  843    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  25.46 
 
 
1381 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  25 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  24.03 
 
 
958 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  22.62 
 
 
395 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
945 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  26.91 
 
 
1478 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  25.89 
 
 
284 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.57 
 
 
1411 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1848  hypothetical protein  24.9 
 
 
517 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0922205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  26.14 
 
 
673 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02023  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 
304 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2232  hypothetical protein  25.63 
 
 
467 aa  49.7  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000103157  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2478  PGAP1 family protein  25.63 
 
 
465 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  23.35 
 
 
977 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  22.49 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.147109 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  25.57 
 
 
1602 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1657  hypothetical protein  25 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  20.64 
 
 
313 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0871  hypothetical protein  41.18 
 
 
364 aa  43.1  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0893  esterase, putative  41.18 
 
 
364 aa  43.1  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1995  PGAP1 family protein  21.58 
 
 
536 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0402712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>