30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3674 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  100 
 
 		 1381 aa  2856    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4221  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1274 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6506  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1269 aa  530  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2475  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1254 aa  498  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2355  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1116 aa  491  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2099  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1286 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00619148  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1237  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1266 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2997  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1281 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  35.6 
 
 		 284 aa  157  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3851  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1288 aa  142  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.970348 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0974  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1278 aa  139  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.035538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  30.9 
 
 		 977 aa  131  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  34.43 
 
 		 1411 aa  131  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 945 aa  129  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2621  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1264 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00523744  normal  0.363558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  32.42 
 
 		 395 aa  124  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  29.44 
 
 		 398 aa  114  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  27.6 
 
 		 1602 aa  89.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  31.5 
 
 		 1478 aa  86.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  29.05 
 
 		 189 aa  85.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3987  hypothetical protein  31.5 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1720  hypothetical protein  38.89 
 
 		 120 aa  70.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  25.46 
 
 		 407 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1719  hypothetical protein  37.36 
 
 		 217 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.680386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  27.53 
 
 		 673 aa  57.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1848  hypothetical protein  23.77 
 
 		 517 aa  53.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0922205  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02326  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14650)  36.17 
 
 		 664 aa  48.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02023  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 		 304 aa  47.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  26.17 
 
 		 437 aa  46.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.14 
 
 		 334 aa  45.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>