16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1848 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1848  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1065    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0922205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  32.64 
 
 		 673 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1354  Nucleoside phosphorylase-like protein  29.46 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.116698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4021  hypothetical protein  30.28 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  26.78 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  25.75 
 
 		 1602 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  28.02 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  27.07 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1381 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  24.9 
 
 		 407 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  26.61 
 
 		 977 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.47 
 
 		 1411 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  25.67 
 
 		 1478 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 945 aa  44.3  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0871  hypothetical protein  42.37 
 
 		 364 aa  43.9  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0893  esterase, putative  42.37 
 
 		 364 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>