22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2941 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  827    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  52.28 
 
 		 398 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3987  hypothetical protein  39.83 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  37.01 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  31.56 
 
 		 977 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1381 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  32.66 
 
 		 1411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 945 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  30.92 
 
 		 1602 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  30.53 
 
 		 1478 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  32.22 
 
 		 189 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1848  hypothetical protein  26.78 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0922205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1720  hypothetical protein  35.51 
 
 		 120 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02023  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  22.62 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06088  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 		 1161 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1719  hypothetical protein  41.57 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.680386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  25.44 
 
 		 673 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00616  conserved hypothetical protein  21.5 
 
 		 202 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0116792  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02326  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14650)  26.01 
 
 		 664 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  35.71 
 
 		 282 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1228  hypothetical protein  27.43 
 
 		 193 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.067938  normal  0.299662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>