20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5005 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  79.43 
 
 
284 aa  290  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  57.69 
 
 
977 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  35.75 
 
 
1411 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  29.05 
 
 
1381 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1719  hypothetical protein  55.88 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.680386  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  30.22 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
945 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1720  hypothetical protein  46.58 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  32.22 
 
 
395 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  30.67 
 
 
1602 aa  69.3  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  27.62 
 
 
1478 aa  58.9  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3987  hypothetical protein  27.61 
 
 
354 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  31.94 
 
 
362 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  24.04 
 
 
673 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  26.89 
 
 
344 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  41.82 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02023  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 
304 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0189  PGAP1 family protein  35.85 
 
 
784 aa  42.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  24.72 
 
 
303 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>