20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1354 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1354  Nucleoside phosphorylase-like protein  100 
 
 		 547 aa  1114    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.116698  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3658  nucleoside phosphorylase-like protein  42.75 
 
 		 1050 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1848  hypothetical protein  29.46 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0922205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1432  purine phosphorylases family protein 1  26.74 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.34 
 
 		 228 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.34 
 
 		 228 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2372  phosphorylase  28.8 
 
 		 944 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0103338  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.68 
 
 		 228 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4021  hypothetical protein  26.4 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1358  purine or other phosphorylase family 1  28 
 
 		 253 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.806507  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4371  purine phosphorylase family 1  25.55 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.81 
 
 		 233 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1473  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.88 
 
 		 229 aa  48.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  25.62 
 
 		 232 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08542  conserved hypothetical protein  40.32 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6154  response regulator receiver protein  23.05 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  38.71 
 
 		 1262 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4195  purine phosphorylase family 1  25.95 
 
 		 508 aa  45.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.67 
 
 		 231 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0542  response regulator receiver domain-containing protein  23.95 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>