73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0542 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0542  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 403 aa  826    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6520  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143497  normal  0.120873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1101  purine or other phosphorylase family 1  34.66 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6154  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 414 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3737  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00211748  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4627  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0563  response regulator receiver domain-containing protein  32.33 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3318  response regulator receiver domain-containing protein  28.25 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625003  normal  0.154296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1534  response regulator receiver domain-containing protein  27.48 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00802449  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4195  purine phosphorylase family 1  28.87 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4179  purine or other phosphorylase family 1  26.98 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.02759  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 662 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 		 1185 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1098  purine phosphorylases family protein 1  27.08 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4034  purine or other phosphorylase family 1  25.58 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2059  purine phosphorylase family 1  29.46 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4371  purine phosphorylase family 1  26.45 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1423  nucleoside phosphorylase-like  33.33 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3658  nucleoside phosphorylase-like protein  25.48 
 
 		 1050 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.48 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1432  purine phosphorylases family protein 1  24.88 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 		 1125 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0301  hypothetical protein  28.23 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.00000593331 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08115  conserved hypothetical protein  36.49 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160028  normal  0.190332 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08542  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08564  Pfs, NACHT, and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06290)  38.16 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1323  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.89 
 
 		 268 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2372  phosphorylase  24.28 
 
 		 944 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0103338  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1364  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.89 
 
 		 264 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370611 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  24.16 
 
 		 1128 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4587  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.14 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3244  response regulator receiver protein  24.65 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1421  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.08 
 
 		 264 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.777512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3198  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.42 
 
 		 284 aa  46.6  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0223  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26 
 
 		 279 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172084  normal  0.611613 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06384  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.840745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.73 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1589  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.22 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.57 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 126 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  29.79 
 
 		 1137 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.73 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1358  purine or other phosphorylase family 1  23.25 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.806507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.73 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.73 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.73 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03283  conserved hypothetical protein  34.25 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0579165  hitchhiker  0.00216318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1137 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 126 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11621  hypothetical protein  34.48 
 
 		 93 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.170689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1159 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1872  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.79 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170055  normal  0.0118137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1354  Nucleoside phosphorylase-like protein  23.95 
 
 		 547 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.116698  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  28 
 
 		 1136 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.55 
 
 		 130 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1443  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.65 
 
 		 264 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0961  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.65 
 
 		 264 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00793  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 		 722 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0479782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  34.69 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  36 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  36 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1338  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.51 
 
 		 272 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  33.67 
 
 		 237 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08323  conserved hypothetical protein  34.21 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1423  AMP nucleosidase  24.61 
 
 		 484 aa  43.1  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1823  AMP nucleosidase  24.74 
 
 		 486 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>