31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6154 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6154  response regulator receiver protein  100 
 
 		 414 aa  853    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6520  response regulator receiver protein  34.14 
 
 		 406 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143497  normal  0.120873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0542  response regulator receiver domain-containing protein  31.94 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3737  response regulator receiver protein  30.54 
 
 		 415 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00211748  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4627  response regulator receiver protein  30.54 
 
 		 415 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0563  response regulator receiver domain-containing protein  32.02 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1101  purine or other phosphorylase family 1  30.32 
 
 		 411 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3318  response regulator receiver domain-containing protein  24.82 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625003  normal  0.154296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1534  response regulator receiver domain-containing protein  26.6 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00802449  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4195  purine phosphorylase family 1  28.89 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3658  nucleoside phosphorylase-like protein  25.63 
 
 		 1050 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0301  hypothetical protein  31.06 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.00000593331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4179  purine or other phosphorylase family 1  28.33 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.02759  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1423  nucleoside phosphorylase-like  31.94 
 
 		 493 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1432  purine phosphorylases family protein 1  24.85 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1177 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4034  purine or other phosphorylase family 1  25 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  25.59 
 
 		 662 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2059  purine phosphorylase family 1  25.77 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.9 
 
 		 1163 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3198  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.54 
 
 		 284 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4371  purine phosphorylase family 1  25 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0302  response regulator  25.5 
 
 		 149 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0396154  decreased coverage  0.00000818495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1426  nucleoside phosphorylase-like  27.68 
 
 		 129 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  26.25 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 220 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1354  Nucleoside phosphorylase-like protein  23.59 
 
 		 547 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.116698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.21 
 
 		 228 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.21 
 
 		 228 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>