49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0563 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0563  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 407 aa  825    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1101  purine or other phosphorylase family 1  44.42 
 
 		 411 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3737  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00211748  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4627  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485266  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6520  response regulator receiver protein  37.81 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143497  normal  0.120873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0542  response regulator receiver domain-containing protein  32.33 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6154  response regulator receiver protein  32.02 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1534  response regulator receiver domain-containing protein  29.34 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00802449  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3318  response regulator receiver domain-containing protein  28.71 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625003  normal  0.154296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4034  purine or other phosphorylase family 1  29.71 
 
 		 302 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3244  response regulator receiver protein  20.77 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4195  purine phosphorylase family 1  23.65 
 
 		 508 aa  57  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1432  purine phosphorylases family protein 1  27.56 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4179  purine or other phosphorylase family 1  27.38 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.02759  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3658  nucleoside phosphorylase-like protein  22.43 
 
 		 1050 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7561  Nucleoside phosphorylase-like protein  25.98 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1423  nucleoside phosphorylase-like  30.97 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2805  response regulator receiver domain-containing protein  32.89 
 
 		 289 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1207 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1231  response regulator  38.1 
 
 		 131 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3950  response regulator/GGDEF domain-containing protein  37.7 
 
 		 566 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 125 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  34.74 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.62 
 
 		 933 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  34.74 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  34.74 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1533  response regulator receiver domain-containing protein  26.03 
 
 		 149 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0503876  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 777 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  32.81 
 
 		 1871 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0301  hypothetical protein  26.87 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.00000593331 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  27.19 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2280  signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 928 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  32.63 
 
 		 218 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0220  MTA/SAH nucleosidase  27.16 
 
 		 236 aa  43.5  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  28.46 
 
 		 244 aa  43.9  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  32.63 
 
 		 218 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  32.63 
 
 		 218 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  32.63 
 
 		 218 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  31.21 
 
 		 268 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  32.63 
 
 		 218 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  33.68 
 
 		 218 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 123 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  33.68 
 
 		 218 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 662 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  34.02 
 
 		 218 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  33.68 
 
 		 218 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 218 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 692 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1566  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 138 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>