More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1231 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1231  response regulator  100 
 
 		 131 aa  269  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1747  response regulator receiver domain-containing protein  76.19 
 
 		 128 aa  206  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.244381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2288  response regulator receiver protein  59.52 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1147  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3115  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 129 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0512  response regulator receiver protein  50.4 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00633837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3357  response regulator receiver protein  57.02 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1566  response regulator receiver protein  48.84 
 
 		 138 aa  135  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  41.25 
 
 		 353 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 		 379 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  27.05 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  30.12 
 
 		 283 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05894  two component transcriptional regulator  27.5 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0399  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 		 384 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0458  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 384 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  27.05 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2451  response regulator  28.97 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 396 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 296 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 294 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0969  response regulator receiver  30.61 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  30.95 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 300 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0148  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 385 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2062  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.88 
 
 		 449 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000496565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  33.33 
 
 		 228 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 296 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2403  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 467 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0968  response regulator receiver domain-containing protein  26.6 
 
 		 317 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.730939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 302 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4608  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.360266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 234 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0374  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0563  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 407 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 984 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  30.95 
 
 		 300 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.6 
 
 		 709 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  34.51 
 
 		 230 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0605  response regulator  38.1 
 
 		 536 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 265 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0969  response regulator receiver domain-containing protein  29.79 
 
 		 328 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 636 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08281  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  27.55 
 
 		 388 aa  46.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5196  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 232 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1102  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.863514 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0763  DNA-binding response regulator  32.94 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00370439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  31.82 
 
 		 297 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 318 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 		 473 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3999  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 567 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 1130 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  36.62 
 
 		 945 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3114  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 462 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000842018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  32.93 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 964 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0452  response regulator ompr  32.84 
 
 		 222 aa  45.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5768  response regulator receiver protein  32.1 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1260  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 331 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1649  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 479 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.22 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.66 
 
 		 231 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  32.14 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 		 461 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2297  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  28.28 
 
 		 1025 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.93563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  32.91 
 
 		 460 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 231 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1732  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 827 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  35.38 
 
 		 681 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0720  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 460 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0301  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 		 360 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.424867  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1917  response regulator receiver  32.43 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  23.77 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 387 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 1222 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 230 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 280 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  30.77 
 
 		 276 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3879  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, fis family protein  29.63 
 
 		 460 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  23.42 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.31 
 
 		 348 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  31.88 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 250 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 657 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 741 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  30.77 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13448  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  30.14 
 
 		 442 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>